Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gja5Q01231 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms