Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp5bP56480 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp5bP56480 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp5bP56480 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp5bP56480 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp5bP56480 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp5bP56480 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp5bP56480 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp5bP56480 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp5bP56480 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp5bP56480 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp5bP56480 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp5bP56480 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp5bP56480 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp5bP56480 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp5bP56480 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp5bP56480 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp5bP56480 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp5bP56480 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp5bP56480 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp5bP56480 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp5bP56480 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms