Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms