Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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