Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms