Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Hoxc11P31313 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Hoxc11P31313 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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