Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P20040 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P20040 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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