Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18524 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18524 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
P18524 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18524 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms