Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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DmdP11531 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DmdP11531 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
DmdP11531 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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DmdP11531 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DmdP11531 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DmdP11531 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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DmdP11531 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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DmdP11531 Gal-201ENSMUST00000025842 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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DmdP11531 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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DmdP11531 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DmdP11531 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DmdP11531 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DmdP11531 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DmdP11531 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DmdP11531 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms