Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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H2-Eb1P04230 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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H2-Eb1P04230 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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H2-Eb1P04230 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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H2-Eb1P04230 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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H2-Eb1P04230 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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H2-Eb1P04230 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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H2-Eb1P04230 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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H2-Eb1P04230 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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H2-Eb1P04230 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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