Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Q1O19441 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms