Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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BC117090L7N257 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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BC117090L7N257 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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BC117090L7N257 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC117090L7N257 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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