Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms