Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
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Gm20825J3QM67 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
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Gm20825J3QM67 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
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Gm20825J3QM67 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
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Gm20825J3QM67 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
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Gm20825J3QM67 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20825J3QM67 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
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