Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms