Protein–RNA interactions for Protein: F7BTS7

Gm5798, Predicted gene 5798, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5798F7BTS7 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5798F7BTS7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5798F7BTS7 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5798F7BTS7 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5798F7BTS7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5798F7BTS7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5798F7BTS7 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5798F7BTS7 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5798F7BTS7 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5798F7BTS7 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5798F7BTS7 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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Gm5798F7BTS7 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5798F7BTS7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Gm5798F7BTS7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Gm5798F7BTS7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Gm5798F7BTS7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Gm5798F7BTS7 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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Gm5798F7BTS7 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Gm5798F7BTS7 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Gm5798F7BTS7 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Gm5798F7BTS7 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Gm5798F7BTS7 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Gm5798F7BTS7 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5798F7BTS7 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5798F7BTS7 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Gm5798F7BTS7 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5798F7BTS7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5798F7BTS7 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Gm5798F7BTS7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Gm5798F7BTS7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5798F7BTS7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5798F7BTS7 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5798F7BTS7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5798F7BTS7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5798F7BTS7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5798F7BTS7 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5798F7BTS7 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5798F7BTS7 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5798F7BTS7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5798F7BTS7 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5798F7BTS7 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5798F7BTS7 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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