Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Pkd1l2-202ENSMUST00000109093 7389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms