Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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Rnf39A2RT81 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Rnf39A2RT81 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Rnf39A2RT81 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Rnf39A2RT81 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Rnf39A2RT81 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Rnf39A2RT81 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Rnf39A2RT81 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Rnf39A2RT81 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Rnf39A2RT81 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
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