Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms