Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUP4

Chst5, Carbohydrate sulfotransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst5Q9QUP4 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Chst5Q9QUP4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Chst5Q9QUP4 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chst5Q9QUP4 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Chst5Q9QUP4 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chst5Q9QUP4 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Chst5Q9QUP4 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Chst5Q9QUP4 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chst5Q9QUP4 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Chst5Q9QUP4 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Chst5Q9QUP4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Chst5Q9QUP4 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chst5Q9QUP4 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chst5Q9QUP4 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chst5Q9QUP4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Chst5Q9QUP4 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chst5Q9QUP4 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Chst5Q9QUP4 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chst5Q9QUP4 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chst5Q9QUP4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chst5Q9QUP4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chst5Q9QUP4 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chst5Q9QUP4 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chst5Q9QUP4 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chst5Q9QUP4 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chst5Q9QUP4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chst5Q9QUP4 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chst5Q9QUP4 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chst5Q9QUP4 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chst5Q9QUP4 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chst5Q9QUP4 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chst5Q9QUP4 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chst5Q9QUP4 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chst5Q9QUP4 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chst5Q9QUP4 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chst5Q9QUP4 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chst5Q9QUP4 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chst5Q9QUP4 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chst5Q9QUP4 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chst5Q9QUP4 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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