Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms