Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfrsf19Q9JLL3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms