Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Hmgn5Q9JL35 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Hmgn5Q9JL35 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Hmgn5Q9JL35 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Hmgn5Q9JL35 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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