Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn2Q9ER65 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms