Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gpr88Q9EPB7 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpr88Q9EPB7 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms