Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Hmg20aQ9DC33 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hmg20aQ9DC33 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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