Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms