Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sdr42e1Q9D665 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdr42e1Q9D665 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdr42e1Q9D665 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdr42e1Q9D665 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdr42e1Q9D665 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdr42e1Q9D665 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdr42e1Q9D665 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms