Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Snx20Q9D2Y5 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms