Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fndc8Q9D2H8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fndc8Q9D2H8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fndc8Q9D2H8 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fndc8Q9D2H8 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fndc8Q9D2H8 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fndc8Q9D2H8 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fndc8Q9D2H8 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fndc8Q9D2H8 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fndc8Q9D2H8 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fndc8Q9D2H8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fndc8Q9D2H8 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fndc8Q9D2H8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fndc8Q9D2H8 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fndc8Q9D2H8 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fndc8Q9D2H8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fndc8Q9D2H8 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fndc8Q9D2H8 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Fndc8Q9D2H8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Fndc8Q9D2H8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Fndc8Q9D2H8 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Fndc8Q9D2H8 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Fndc8Q9D2H8 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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