Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rab5aQ9CQD1 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rab5aQ9CQD1 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rab5aQ9CQD1 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rab5aQ9CQD1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rab5aQ9CQD1 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rab5aQ9CQD1 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rab5aQ9CQD1 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Rab5aQ9CQD1 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Rab5aQ9CQD1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Rab5aQ9CQD1 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Rab5aQ9CQD1 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Rab5aQ9CQD1 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Rab5aQ9CQD1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Rab5aQ9CQD1 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Rab5aQ9CQD1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Rab5aQ9CQD1 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Rab5aQ9CQD1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rab5aQ9CQD1 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
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