Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms