Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Rpl7a-ps12-201ENSMUST00000120384 794 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Zfp419-201ENSMUST00000173446 916 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 AC156633.1-201ENSMUST00000215971 614 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm13201-201ENSMUST00000144031 600 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm20610-201ENSMUST00000176406 587 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms