Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Lrrtm1Q8K377 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Lrrtm1Q8K377 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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