Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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FgbQ8K0E8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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FgbQ8K0E8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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FgbQ8K0E8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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FgbQ8K0E8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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FgbQ8K0E8 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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FgbQ8K0E8 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms