Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Rpl7l1-201ENSMUST00000078286 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 M1ap-201ENSMUST00000113980 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nupl2Q8CIC2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms