Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH72

Trim32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim32Q8CH72 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim32Q8CH72 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Trim32Q8CH72 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim32Q8CH72 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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