Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp20Q8C6M1 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp20Q8C6M1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp20Q8C6M1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp20Q8C6M1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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