Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ccdc113Q8C5T8 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ccdc113Q8C5T8 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ccdc113Q8C5T8 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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