Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssxb10Q6XAR7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssxb10Q6XAR7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ssxb10Q6XAR7 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ssxb10Q6XAR7 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssxb10Q6XAR7 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssxb10Q6XAR7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ssxb10Q6XAR7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssxb10Q6XAR7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ssxb10Q6XAR7 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ssxb10Q6XAR7 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssxb10Q6XAR7 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ssxb10Q6XAR7 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssxb10Q6XAR7 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ssxb10Q6XAR7 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Ssxb10Q6XAR7 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Ssxb10Q6XAR7 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssxb10Q6XAR7 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Ssxb10Q6XAR7 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssxb10Q6XAR7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssxb10Q6XAR7 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssxb10Q6XAR7 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssxb10Q6XAR7 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssxb10Q6XAR7 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssxb10Q6XAR7 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssxb10Q6XAR7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssxb10Q6XAR7 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssxb10Q6XAR7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssxb10Q6XAR7 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssxb10Q6XAR7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssxb10Q6XAR7 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssxb10Q6XAR7 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssxb10Q6XAR7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssxb10Q6XAR7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms