Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm11191-201ENSMUST00000117231 610 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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