Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms