Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms