Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Ifi47Q61635 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifi47Q61635 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifi47Q61635 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifi47Q61635 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifi47Q61635 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifi47Q61635 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifi47Q61635 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifi47Q61635 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifi47Q61635 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifi47Q61635 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifi47Q61635 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifi47Q61635 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifi47Q61635 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifi47Q61635 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifi47Q61635 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifi47Q61635 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifi47Q61635 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifi47Q61635 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifi47Q61635 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifi47Q61635 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms