Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Mir124-2hg-204ENSMUST00000188983 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm44951-201ENSMUST00000206449 2024 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm3550-201ENSMUST00000105038 1656 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Trpv2-201ENSMUST00000018651 2909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms