Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

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Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Slc5a6Q5U4D8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Slc5a6Q5U4D8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Slc5a6Q5U4D8 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Slc5a6Q5U4D8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Slc5a6Q5U4D8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms