Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psme4Q5SSW2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms