Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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