Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms