Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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